南京住房公积金管理中心为市政府直属不以营利为目的的独立的事业单位，其主要职能为编制、执行南京地区住房公积金的归集、使用计划；记载南京地区职工住房公积金的缴存、提取、使用等情况；负责南京地区住房公积金的核算；审批南京地区住房公积金的提取、使用；负责南京地区住房公积金的保值和归还；编制南京地区住房公积金归集、使用计划执行情况的报告；承办南京住房公积金管理委员会决定的其他事项。

　　南京住房公积金管理中心受理的业务包括住房贷款（包括组合贷款和受理商业贷款）；为借款人提供住房置业担保服务；住房公积金委托提取还贷；住房公积金和新职工住房补贴提取；单位住房公积金开（销）户登记；住房公积金卡务；住房公积金个人帐户查询；住房公积金和住房金融政策咨询。